nat med | ပေါင်းစည်းထားသောအကျိတ်ကိုမြေပုံဆွဲရန် Multi-Omics ချဉ်းကပ်မှု

nat med | ပေါင်းစည်းထားသောအကျိတ်ကိုမြေပုံဆွဲခြင်းအတွက်လျစ်လျူရှုသောအကျင်းနှင့်အရောင်အသွေးစုံခြင်းနှင့်အူကစ်ကင်ဆာရောဂါ၏ဆိုးကျိုးများကကိုယ်ခံစွမ်းအားစနစ်နှင့်အပြန်အလှန်ဆက်သွယ်မှုကိုဖော်ပြသည်
အဓိကအားဖြင့်အဓိကအားဖြင့်အူမကြီးကင်ဆာကိုကျယ်ကျယ်ပြန့်ပြန့်လေ့လာခဲ့သော်လည်းကုသမှုဆိုင်ရာအကြံပြုချက်များကိုဆုံးဖြတ်ရန်အတွက် DNA Michatch Requests (MMR) Dena Microsmatch Reality (MOMR) DNA MOMSITES (MOMR) ကိုရှာဖွေတွေ့ရှိခြင်းနှင့် MicroN Microsology Institute (Micromology Institute) တွင်သာမှီခိုနေရသည်။ သုတေသီများကမျိုးရိုးဗီဇအသုံးများသောကိုယ်ခံအားဖြင့်ကိုယ်ခံတွင်းကိုတုန့်ပြန်မှုများအကြားအသင်းအဖွဲ့များ,

သုတေသနပြုမှုတိုးတက်လာသည်နှင့်အမျှကင်ဆာရောဂါ, ကိုယ်ခံစွမ်းအားကိုယ်ခံတွင်း,
phenotypic ရှုပ်ထွေးမှုနှင့်ရလဒ်အကြားဆက်နွယ်မှုကိုခွဲစိတ်ကုသမှုကိုကာတာရှိ Sidra Institute မှသုတေသီများကကာတာရှိသုတေသီများအဖွဲ့တစ်ဖွဲ့သည်အဏုဇီဝဗေဒဆိုင်ရာဝိသေသလက္ခဏာများနှင့်ကိုယ်အကာစမဂျာဆန်မှု (ICR) ကိုပေါင်းစပ်ခြင်းဖြင့်ကောင်းမွန်သောရှင်သန်မှုနှုန်းထားများရှိသည့်လူနာအုပ်စုကိုဖော်ထုတ်နိုင်ခဲ့သည်။ အဆိုပါအဖွဲ့သည်အကြှနျုပျတို့၏အကျိတ်မျိုးစေ့တစ်မျိုးတည်းနှင့်အတူအကျိတ်မျိုးစေ့တစ်မျိုးတည်းနှင့်အတူအကျိတ်မျိုးစေ့တစ်မျိုးတည်းနှင့်အတူဖြည့်ဆည်းသည့်မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာတစ်သျှူးနှင့်အတူဘက်တီးရီးယားမျိုးရိုးဗီဇနှင့်လိုက်ဖက်သောအကျိတ်မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာအစီအစဉ်များနှင့်အတူဘက်တီးရီးယားမျိုးရိုးဗီဇအစီအစဉ်များကိုဖြည့်ဆည်းပေးခဲ့သည်။ လေ့လာမှုကိုသဘာဝဆေးပညာတွင် "ပေါင်းစည်းထားသောအကျိတ်နှင့်အူမကြီးကင်ဆာရောဂါဆိုင်ရာအုံကြွမှု Atlas" အဖြစ်ပုံနှိပ်ထုတ်ဝေခဲ့သည်။
သဘာဝဆေးပညာထုတ်ဝေခဲ့သောဆောင်းပါး

သဘာဝဆေးပညာထုတ်ဝေခဲ့သောဆောင်းပါး

AC-ICAM ခြုံငုံသုံးသပ်ချက်

သုတေသီများသည် orthogonal genromic platform ကိုလတ်ဆတ်သောအေးခဲနေသောအခွံကိုဆန်းစစ်ရန်နှင့်ကပ်လျက်ကျန်းမာသောအူမန်းတစ်ရှူး (အကျိတ်ပုံမှန်အတွဲများ) ကိုအသုံးပြုသည်။ Exenome Sequencing (Wes), RNA-SEES), RNO-SEQ အချက်အလက်အရည်အသွေးထိန်းချုပ်မှုနှင့်ပါ 0 င်မှုစံနှုန်းများနှင့်ပါ 0 င်ခြင်းဆိုင်ရာစံနှုန်းများဆိုင်ရာစစ်ဆေးမှုများ, သုတေသနအဖွဲ့သည်ဤအရင်းအမြစ် Sidra-Lumc Ac-ICAM ကိုအမည်ပေးခဲ့သည်။

ICR ကို အသုံးပြု. မော်လီကျူးအမျိုးအစားခွဲခြားခြင်း

0 မ်းနည်းခြင်းနှင့်အဆက်မပြတ်အဆက်မပြတ်ကင်ဆာရောဂါအတွက်ကိုယ်ခံစွမ်းအားမျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာအမှတ်အသားများကိုဖမ်းယူခြင်းဖြင့်သုတေသနအဖွဲ့သည် ICR သည် ICR ကိုအကောင်းဆုံးဖြစ်စေပြီး Melanoma, ဆီးအိမ်တွင်းကင်ဆာအပါအ 0 င်ကင်ဆာအမျိုးအစားများကိုဖုံးအုပ်ထားသည့်မျိုးရိုးဗီဇမျိုးစုံကိုဖုံးအုပ်ထားသည်။ ICR သည်ရင်သားကင်ဆာအပါအ 0 င်ကင်ဆာအမျိုးအစားအမျိုးမျိုးတွင် immunotheremyapy response နှင့်လည်းဆက်စပ်ခဲ့သည်။

ပထမ ဦး စွာသုတေသီများသည် ICR (Tumors), အလယ်အလတ် icr နှင့် ICR နှင့် ICR (အအေးပိုင်း) (အအေးခန်း) (အရောင်အသွေးစုံခြင်း) ကိုခွဲခြားရန် IC-ICAM cohort ကို CONRE အခြေစိုက် COSHART SCASTIONCACE COSTICATICE CACHATCHETCATE COCAM လက်မှတ်ကိုအတည်ပြုခဲ့သည်။ Collections သည် Consensus Moolarular Subtypes (CMS) နှင့်ဆက်စပ်သောကိုယ်ခံစွမ်းအားကိုသုတေသနပြုသည်။ CMS အမျိုးအစားများတွင် CMS1 / ကိုယ် 0 င်များ, CMS2 / Canonical, CMS3 / Metabolic နှင့် CMS4 / Mesenchymal တို့ပါ 0 င်သည်။ ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းက ICR ရမှတ်များသည် CMS Subtypes အားလုံးရှိကင်ဆာဆဲ (ဂန္ထဝင်အခန်းများရှိကင်ဆာဆဲလ်လမ်းကြောင်းများနှင့်ဆိုးကျိုးသက်ရောက်စေပြီး immunosuppressive နှင့် stromal-relment ည့်သည်များနှင့်ဆက်စပ်သောလမ်းကြောင်းများနှင့်အတူ CMS4 အကျိတ်များတွင်သာတွေ့ရှိခဲ့သည်။

CMS အားလုံးတွင်သဘာဝလူသတ်သမား (NK) ဆဲလ်များပေါများခြင်းနှင့် Terr 1C) တွင်အရောင်အသွေးစုံလင်သောအရောင်များ (ပုံ 1c) တွင်ပိုမိုကောင်းမွန်သောအရောင်များကိုပိုမိုကောင်းမွန်သောအမြင့်ဆုံး (ပုံ 1D) တွင်ပိုမိုကြီးမားသော OS နှင့် PFS တို့တွင်ကွဲပြားခြားနားသော OS နှင့် PFS တို့တွင်ကွဲပြားခြားနားသော OS နှင့် PFS တို့တွင်ရှိသည်။

1

ပုံ 1 ။ AC-ICAM လေ့လာမှုဒီဇိုင်း, ကိုယ်ခံစွမ်းအားနှင့်သက်ဆိုင်သည့်မျိုးရိုးဗီဇလက်မှတ်, ကိုယ်ခံစွမ်းအားနှင့်မော်လီကျူးများနှင့်ရှင်သန်မှု။
ICR သည်အကျိတ်ကိုကြွယ်ဝသောအစိတ်အပိုင်းများကိုချဲ့ထွင်ခြင်း,
TRESS ၏လူနည်းစုသာလူနည်းစုသာအကျိတ်တစ်သျှူးကိုထိုးဖောက် 0 င်ရောက်နိုင်သည့်အကျိတ်အနိမ့်အမြင့် (10% အောက်) အတွက်တိကျစွာဖော်ပြသည်။ ထို့ကြောင့်အကျိတ် TE ဆဲလ်အများစုကိုကြည့်ရှုသူ T ဆဲလ်များ (ကြည့်ရှုသူ T ဆဲလ်များ) အဖြစ်ရည်ညွှန်းသည်။ အကျိုးဖြစ်ထွန်းသော TCRs နှင့်အတူသမားရိုးကျ T ကဆဲလ်အရေအတွက်နှင့်အတူအပြင်းထန်ဆုံးဆက်စပ်မှုကို Stromal Cell နှင့် Leukocyte Subpopulatics တွင် (ပုံ 2A) ကိုခန့်မှန်းရန် (ပုံ 2,) ကိုခန့်မှန်းရန် (RNA 2A) တွင်ပြုလုပ်နိုင်သည်။ ICR Clusters (CMMS နှင့် CMS အမျိုးအစားခွဲခြားခြင်း) တွင် ICR-High နှင့် CMS Subjype CMS1 / ကိုယ်ထည်များ၌ CMS Subtype CMS1 / ကိုယ်ထည်အုပ်စုများ (ပုံ 2c) တွင်တွေ့ရသည်။ TCR NECS ခြောက်ခု (IFFG, Stat1, IFF1, IRF1, CXCL10) တစ်ခုလုံး (IFFG, Stat1, IFF1, IRF1, CXCL10) သည် TCR ၏ထိပ်တန်းဂိတ်မျိုးဆက်များအနက် (1) မျိုးဆက်တွင်အသုံးပြုသည်။ immenoseq tcr မျိုးရိုးဗီဇများသည်အကျိတ်တုံ့ပြန်မှု CD8 + အမှတ်အသားများကိုအသုံးပြုခြင်းထက် ICR မျိုးရိုးဗီဇအများစုနှင့်ပိုမိုပြင်းထန်လာသည် (ပုံ 2F နှင့် 2G) ကိုအသုံးပြုသည်။ နိဂုံးချုပ်အနေဖြင့်အထက်ဖော်ပြပါဆန်းစစ်ခြင်းက ICR လက်မှတ်သည်အကျိတ်ကြွယ်ဝသော,
2
ပုံ 2 ။ ကိုယ်ခံစွမ်းအားဆက်စပ်ဗီရင်းများ, ကိုယ်ခံစွမ်းအားကိုယ်ခံစွမ်းအားနှင့်မော်လီကျူးများဖြင့် TCR မက်ရင်မက်ထရစ်နှင့်ဆက်စပ်မှု။
ကျန်းမာနှင့်အူမကြီးကင်ဆာတစ်သျှူးများတွင် microbiome ဖွဲ့စည်းမှု
သုတေသီများကလိုက်ဖက်သောအကျိတ်နှင့်ကျန်းမာသောအူမကြီးတစ်ရှူးမှ 246 လူနာများ (ပုံ 3A) မှထုတ်ယူထားသော DNA ကို အသုံးပြု. DNA ကို အသုံးပြု. DNA ကို အသုံးပြု. RRNNA အစီအစဉ် 16S ကိုပြုလုပ်ခဲ့သည်။ အတည်ပြုချက်အတွက်သုတေသီများကသုတေသီများကအပိုဆောင်းအကျိတ်မျိုးရိုးမနမူနာများကိုထပ်မံခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအတွက်ရရှိနိုင်သည့်ပုံမှန် DNA ကိုလိုက်ဖက်ခြင်းမရှိသေးသည့်အကျိတ်မျိုးရိုးဗီဇဆိုင်ရာအချက်အလက်များကိုဖြည့်ဆည်းပေးခဲ့သည်။ ပထမ ဦး စွာသုတေသီများသည်ဆွေမျိုးများအပေါများကိုလိုက်ဖက်သောအတုံးများနှင့်ကျန်းမာသောအူမကြီးတစ်ရှူးများနှင့်နှိုင်းယှဉ်ခဲ့သည်။ Clostridium Profringens သည်ကျန်းမာသောနမူနာများနှင့်နှိုင်းယှဉ်လျှင်အကျိတ်များတွင်သိသိသာသာတိုးပွားလာသည် (ပုံ 3D 3D) ။ alpha မတူကွဲပြားမှု (နမူနာတစ်ခုတည်းအတွက်မျိုးစိတ်များကွဲပြားမှုနှင့်မျိုးစိတ်များအတွက်မျိုးစိတ်များအတွက်မျိုးစိတ်ကြွယ်ဝမှု) သိသိသာသာကွာခြားမှုမရှိခဲ့ပါ။ ICR-High Rumors နှင့်နှိုင်းယှဉ်ပါကပိုးမွှားများ၌ပိုးမွှားများနှင့်စပ်လျဉ်း။ ပိုးမွှားများနှင့်စပ်လျဉ်း။ အဏုဇီဝဗေဒဆိုင်ရာကွဲပြားမှုများကိုလျှော့ချခဲ့သည်။
Microbial profile profiles နှင့်လက်တွေ့ရလဒ်များအကြားဆေးကုသမှုဆိုင်ရာသက်ဆိုင်ရာအသင်းအဖွဲ့များကိုရှာဖွေရန်သုတေသီများသည်ရှင်သန်ရပ်တည်ရေးကိုကြိုတင်ခန့်မှန်းထားသည့် microbiome features များကိုခွဲခြားသတ်မှတ်ရန် 16S RRNA မျိုးဗီဇအစီအစဉ်များကိုအသုံးပြုရန်ရည်ရွယ်သည်။ MBR Classiers ဟုခေါ်သော ac-icam246 တွင်သုတေသီများသည် MBR အမျိုးအစားများ (ကိန်းဂဏန်း 3F) ဟုခေါ်သည့် (ကွဲပြားခြားနားသောသေဆုံးမှုအန္တရာယ်များနှင့်ဆက်စပ်သောကိန်းဂဏန်းများ) နှင့်အတူအင်္ဂါရပ် 41 ခုပါ 0 င်သော OS COX Regression Model ကိုဖွင့်လှစ်ခဲ့သည်။
ဤလေ့ကျင့်ရေးအဖွဲ့ (ICAM246) တွင် MBR ရမှတ် (MBR) ရမှတ် (MBR) ရမှတ် (MBR <0, အနိမ့် MBR) သည်သေခြင်း (85%) သိသိသာသာနိမ့်ကျခြင်းနှင့်ဆက်စပ်နေသည်။ သုတေသီများက MBR (စွန့်စားမှုများ) နှင့်လွတ်လပ်စွာအတည်ပြုထားသော cohorts နှစ်ခု (ICAM42 နှင့် TCGA-Coad) နှစ်ခုတွင် MBR (စွန့်စားမှု) နှင့်ကြာရှည်စွာ OS အကြားရှိအဖွဲ့ကိုအတည်ပြုခဲ့သည်။ ပုံ 3) လေ့လာမှုကအကျိတ်နှင့်ကျန်းမာသောအူမကြီးနှင့်ဆင်တူသည့် Endogastric Cocci နှင့် MBR ရမှတ်များအကြားခိုင်မာသောဆက်စပ်မှုကိုပြသခဲ့သည်။
သုံး
ပုံ 3 ။ အကျိတ်နှင့်ကျန်းမာသောတစ်သျှူးများရှိအဏုဇီဝဗေဒနှင့် ICR နှင့်လူနာရှင်သန်မှုနှင့်ဆက်ဆံရေးရှိသည့်အဏုဇီဝဗေဒ။
ကောက်ချက်
ဤလေ့လာမှုတွင်အသုံးပြုသော Multics Multics Multics ချဉ်းကပ်မှုသည်အူမီးစ်ကင်ဆာရောဂါဖြင့်ခုခံကာကွယ်မှု၏မော်လီကျူးတုန့်ပြန်မှု၏မော်လီကျူးဆိုင်ရာလက်မှတ်ကိုသေချာစွာရှာဖွေတွေ့ရှိခြင်းနှင့်ခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအားဖြင့်ပိုးသတ်ဆေးနှင့်ကိုယ်ခံစွမ်းအားစနစ်အကြားအပြန်အလှန်ဆက်သွယ်မှုကိုဖော်ပြသည်။ နက်ရှိုင်းသော TCR သည်အကျိတ်နှင့်ကျန်းမာသောတစ်ရှူးများအပေါ်လေ့လာခြင်းကြောင့် ICR ၏ဟောကိန်းသည်အကျိတ်အားသန်စွမ်းသောအကျိတ်ကိုဖမ်းယူနိုင်ပြီးအကျိတ် antigen cell plone များကိုဖမ်းယူနိုင်စွမ်းရှိသည်ဟုဖော်ပြခဲ့သည်။

အကျိတ် microbiome ဖွဲ့စည်းမှုကိုခွဲခြမ်းစိတ်ဖြာခြင်းအားဖြင့် 16s rrna gene gene sequencencing ac-Icam တွင် 16s rrna gene sequencencing ကို အသုံးပြု. အသင်းသည် MicroBiome လက်မှတ် (MBR အန္တရာယ်ရမှတ်) ကိုဖော်ထုတ်ခဲ့သည်။ ဒီလက်မှတ်ကိုအကျိတ်နမူနာတွေကနေဆင်းသက်လာပေမယ့်ကျန်းမာရေးအခြေအနေနဲ့အကျိတ် MBR အန္တရာယ်ရမှတ်တွေအကြားခိုင်မာတဲ့ဆက်စပ်မှုရှိတယ်, ICR နှင့် MBR ရမှတ်များကိုပေါင်းစပ်ခြင်းအားဖြင့်၎င်းသည်အူမကြီးကင်ဆာရောဂါရှိသောလူနာများအတွက်ရှင်သန်မှုကိုကြိုတင်ခန့်မှန်းနိုင်သည့် Omic Multic Omic Biomarker ကိုခွဲခြားသတ်မှတ်ရန်နှင့်အတည်ပြုရန်ဖြစ်နိုင်သည်။ လေ့လာမှု၏ Multi-Omic Dataset သည်အူမကြီးကင်ဆာဇီဝဗေဒကိုပိုမိုနားလည်ရန်နှင့်ကိုယ်ပိုင်ကုထုံးဆိုင်ရာချဉ်းကပ်မှုများကိုရှာဖွေတွေ့ရှိရန်အရင်းအမြစ်ကိုထောက်ပံ့ပေးသည်။

ကိုးကားစရာ:
roelks, J. , kuppen, pjk, ahmed, ei et al ။ ပေါင်းစည်းထားသောအကျိတ်နှင့်ကိုယ်ခံနူနာနှင့်အူမကြီးကင်ဆာ၏ microbiome Atlas ။ NAM Med Med 29, 1273-1286 (2023) ။


အချိန် - ဇွန် - 15-2023
သီးသန့်လုံခြုံရေးချိန်ညှိချက်များ
cookie ခွင့်ပြုချက်ကိုစီမံပါ
အကောင်းဆုံးအတွေ့အကြုံများပေးရန်ကျွန်ုပ်တို့သည်စက်ပစ္စည်းအချက်အလက်များကိုသိုလှောင်ရန်နှင့် / သို့မဟုတ်ရယူရန် cookies များကဲ့သို့နည်းပညာများကိုအသုံးပြုသည်။ ဤနည်းပညာများကိုလက်ခံခြင်းသည်ဤဆိုဒ်ရှိအပြုအမူသို့မဟုတ်ထူးခြားသော IDs များကို browsing လုပ်ခြင်းကဲ့သို့သောအချက်အလက်များကိုလုပ်ဆောင်ရန်ခွင့်ပြုလိမ့်မည်။ သဘောတူခွင့်ပြုချက်ကိုသဘောတူခြင်းသို့မဟုတ်ထုတ်ယူခြင်းသည်အချို့သောလုပ်ဆောင်မှုများနှင့်လုပ်ဆောင်ချက်များကိုဆိုးကျိုးသက်ရောက်နိုင်သည်။
✔လက်ခံခဲ့သည်
✔လက်ခံပါ
ငြင်းပယ်ခြင်းနှင့်ပိတ်ပါ
X